מקורם של חוקים אלו מתקופת בית המקדש שבו היה איסורים שונים על כניסה לבית המקדש.
איסורים אלו כללו בעבר איסורים על כלל האוכלוסיה והמילה נידה התייחסה גם לגברים.
כלומר איסור להכנס לתחומי בית המקדש בתקופה בה אדם נחשב טמא ולכן אינו יכול לעסוק בענייני קדושה.
לפי המקורות כל היהודים נמצאים במצב טומאה בשלב זה או אחר בחייהם, קימיים אוסף של הלכות וחוקים בנושא טומאה וטהרה (טומאת הנפש, טומאת הגוף).
טמאה הינה הגדרה לפרקי זמן שונים שבהם נמצא אדם שבגינם, לדוגמא ביקור בבית קברות או אכילת בשר טמא, נאסר עליו להתקרב לדברים קדושים (בית מקדש, בית תפילה, דברי קודש וכו) .
קימיים דרגות שונות של של טומאה, בחלק מהמקרים ניתן לטבול במקווה מיד כבר באותו היום ולסיים את תהליך הטהרה וחלק אחר מהמקרים ישנו תהליך ארוך ומורכב יותר הכולל טקסים שונים.
אחד מטקסי הטהרה הארוכים ושנויים במחלוקת הוא טקס הטהרות מוזר וחסר הגיון הנקרא "מצוות פרה אדומה".
הטקס מתייחס להטהרות במקרה של טומאת מת, כלומר כאשר יהודי בא במגע עם גופת מת.
לפי המקורות יש לשחוט פרה אדומה לחלוטין שמעולם לא עבדה בשדה בעבודה קשה, אסור שלפרה תהיה אפילו שערה אחת שאינה אדומה אחרת היא פסולה.
לאחר השחיטה, השוחט מזלף מדם הפרה שבע פעמים על מפתן המקדש, לאחר מכן שורפים את הפרה ואת אפר הפרה הדומה בוזקים על האדם הטמא.
כאמור, לפי המקורות הטהרות וניקוי הטומאה כרוכים בתהליכים וטקסים שונים אשר טבילה במקווה הוא תמיד השלב האחרון בתהליך ההטהרות.
בשנים האחרונות הצורך במקוואות בישראל הלך וגדל, לכן טהרת הבית תרומה ואיתם עמותות וגופים מזרמים שונים עוסקים בגיוס כספים למטרה זו.
גם חוקי הטהרה המשפחתי אשר אוסרים כל כל מגע מיני או פיזי כאשר אישה נמצאת בתקופת המחזור וגם שבוע שלאחר סיום המחזור (תקופת הפרדה), מורכבים מאיסורים ומושגים שונים הנוגעים לשלבים השונים בתהליך ההטהרות.
ייחוד: חוק האוסר על גבר ואישה שאינם נשואים להמצא באותו חדר או חלל נסתר שלאחרים אין אפשרות לראות אותם.
תשמיש (או תשמיש המיטה): יחסי אישות בין בנ זוג.
לפי ההלכה ישנם חוקים וסייגים לגביי האופן שבו יש לקיים יחסי אישות. קימיים חוקים והוראות לכל התהליך: מקום, תדירות, עיתוי, דיבור, ואפילו למחשבה בשעת קיום היחסים.
מצות עונה: חיוב הבעל בקיום יחסים מין עם אישתו, בדומה למצוות פרייה ורבייה.
נידה: התקופה שבה לאישה אסור לקיים יחסי מין עם בעלה ואפילו לא ליצור מצב של מגע פיזי כשלהו.
כלומר, מרגע קבלת המחזור ועד ליום הטבילה המקווה פרק זמן הנקרא ה"רחקה".
הרחקה: אוסף דינים הקשורים בריחוק הגופני שבין בעל ואישתו בזמן ימי הנידה.
עד בדיקה: פיסת בד לבנה מכותנה בעזרתה אשה בודקת את הנרתיק, האם דימום המחזור הסתיים.
שבעה נקיים: מתייחס לתקופה הנספרת ע"י האישה מרגע בדיקת 'הפסק טהרה' ועד לטבילתה במקווה (שבעה ימים מלאים).
מקוה: בריכה המיועדת לטבילה. מקור המים חייב להיות ממי גשמים, או מי מעיינות ולא כאלו שנשאבו בכוח האדמה.
בלנית: עובדת במקוה המלווה ומשגיחה על תהליך הטבילה בהתאם להלכה, כלומר שהטבילה תהיהי מלאה לחלוטין ושאפילו ששיער האישה הטובלת לא יצוף מעל פני המים או שגופה לא יגע בדפנות בריכת המקווה.
